RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RNFT2Q96EX2 444 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PELI1Q96FA3 418 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPE3 182 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SSTR5P35346 364 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB136Q30KP8 78 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NKAPLQ5M9Q1 402 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 AP4S1Q9Y587 144 aa20.16■□□□□ 0.82
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CAPNS1-211ENST00000590874 J3QLW9 94 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-211ENST00000590874 CIB2O75838 187 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf36Q96KX1 117 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-211ENST00000590874 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-211ENST00000590874 SULT1B1O43704 296 aa20.14■□□□□ 0.81
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CAPNS1-211ENST00000590874 TEX38Q6PEX7 206 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10X1Q8NGY0 326 aa20.14■□□□□ 0.81
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CAPNS1-211ENST00000590874 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF581Q9P0T4 197 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 AP4M1O00189 453 aa20.12■□□□□ 0.81
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGYQ3MUY2 71 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 MOB3BQ86TA1 216 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA12Q8IW75 414 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP16Q8N5Y8 322 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8N6K4 173 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PXT1Q8NFP0 134 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10A7Q8NGE5 316 aa20.12■□□□□ 0.81
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CAPNS1-211ENST00000590874 ACBD7Q8N6N7 88 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8N9W7 124 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5D14Q8NGL3 314 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5M8Q8NGP6 311 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10K1Q8NGX5 313 aa20.11■□□□□ 0.81
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CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DS1Q14954 304 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf66Q5T8R8 295 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.1■□□□□ 0.81
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A30Q5SVS4 291 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51A2Q8NGJ7 313 aa20.09■□□□□ 0.81
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CAPNS1-211ENST00000590874 AASSQ9UDR5 926 aa20.09■□□□□ 0.81
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CAPNS1-211ENST00000590874 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
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CAPNS1-211ENST00000590874 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 LHFPL3Q86UP9 236 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF152Q8N8N0 203 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 LGALS12Q96DT0 336 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.08■□□□□ 0.81
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