RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GNB1	P62873	340 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CFHR3	Q02985	330 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GPR176	Q14439	515 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF141	Q15928	474 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TP53I3	Q53FA7	332 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CEP78	Q5JTW2	689 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PXK	Q7Z7A4	578 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SYT9	Q86SS6	491 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772		Q8N402	240 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	DEFB125	Q8N687	156 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ABHD4	Q8TB40	342 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM63	Q969Q1	353 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	C4orf36	Q96KX1	117 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GFI1	Q99684	422 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	KCNJ15	Q99712	375 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	COQ7	Q99807	217 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	NLK	Q9UBE8	527 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF221	Q9UK13	617 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	COPS3	Q9UNS2	423 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MED31	Q9Y3C7	131 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ALG5	Q9Y673	324 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PPK0	400 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PRG6	482 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR6C68	A6NDL8	312 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	FAM25A	B3EWG3	89 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	FAM25C	B3EWG5	89 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	FAM25G	B3EWG6	89 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SMLR1	H3BR10	107 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MLNR	O43193	412 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LYRM1	O43325	122 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SELENOF	O60613	162 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR7A10	O76100	309 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GYPA	P02724	150 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	KRT8	P05787	483 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PSKH1	P11801	424 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ATF1	P18846	271 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	STOM	P27105	288 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC6A6	P31641	620 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PYCR1	P32322	319 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ATP12A	P54707	1039 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IL18	Q14116	193 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CDK10	Q15131	360 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TATDN3	Q17R31	274 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC36A2	Q495M3	483 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZFP69	Q49AA0	526 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TRIQK	Q629K1	86 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MZT2A	Q6P582	158 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OAF	Q86UD1	273 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CADM2	Q8N3J6	435 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF561	Q8N587	486 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR4K13	Q8NH42	304 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	AP3S1	Q92572	193 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RASD2	Q96D21	266 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ORAI1	Q96D31	301 aa		3.61	□□□□□ -1.83

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