RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 HSF4Q9ULV5 492 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 PNLIPP16233 465 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 19
PTPRM-211ENST00000580170 PPYP01298 95 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF273Q14593 569 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 PDPNQ86YL7 162 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF738Q8NE65 137 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS1P07477 247 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 C3AR1Q16581 482 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 OVCH2Q7RTZ1 564 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 DTD1Q8TEA8 209 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 RNF2Q99496 336 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 ADTRPQ96IZ2 230 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 SLC7A10Q9NS82 523 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 OR2H1Q9GZK4 316 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 EML2O95834 649 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 ACTL6AO96019 429 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 EFNB2P52799 333 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TCL1AP56279 114 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 HELTA6NFD8 242 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 PIGYQ3MUY2 71 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 SCN1AP35498 2009 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TNFSF14O43557 240 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 GPA33Q99795 319 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 H3BVH4 76 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB124Q8NES8 71 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 NPIPB8E9PQR5 432 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 RHBDL1O75783 438 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 FAM219AQ8IW50 185 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 VAX2Q9UIW0 290 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 PARP11Q9NR21 331 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 F12P00748 615 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 VSIG8P0DPA2 414 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 VDAC1P21796 283 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 SOX8P57073 446 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 LYZL2Q7Z4W2 148 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 RHOVQ96L33 236 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 NKX2-6A6NCS4 301 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 ISXQ2M1V0 245 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00518Q8N0U6 118 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 OR4P4Q8NGL7 312 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 OR51M1Q9H341 326 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 CA10Q9NS85 328 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 MS4A18H0YCH9 400 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEA5P43359 124 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 FOXO1Q12778 655 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 PSG5Q15238 335 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 MS4A18Q3C1V0 323 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 VSIG4Q9Y279 399 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 CHAC2Q8WUX2 184 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TREM2Q9NZC2 230 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 DIRC3C9JPN6 131 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 CDIPTO14735 213 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 DEDDO75618 318 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 RNF133Q8WVZ7 376 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 SMOC1Q9H4F8 434 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 THYN1Q9P016 225 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 D2HGDHQ8N465 521 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM116Q8NCL8 245 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 OR2Y1Q8NGV0 311 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 SSMEM1Q8WWF3 244 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 GLRX2Q9NS18 164 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 KLK13Q9UKR3 277 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 IFITM10A6NMD0 228 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TMPRSS2O15393 492 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 AGFG2O95081 481 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM211Q6ICI0 200 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 SCGB1D4Q6XE38 83 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 ZPLD1Q8TCW7 415 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 GRAMD2BQ96HH9 432 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 GPR35Q9HC97 309 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TCFL5Q9UL49 500 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 SLC23A3Q6PIS1 610 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 CEACAM3P40198 252 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 CES1P1Q9UKY3 287 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 PAPPAQ13219 1627 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 G6PCP35575 357 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 MGAT2Q10469 447 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 FDX2Q6P4F2 183 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 VSTM2AQ8TAG5 236 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 MRGPRFQ96AM1 343 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 UCN2Q96RP3 112 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms