RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 GPR37O15354 613 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 RAB5AP20339 215 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 OMGP23515 440 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SLC10A1Q14973 349 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 OR2C3Q8N628 320 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 CALHM2Q9HA72 323 aa9.81□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 NKX2-6A6NCS4 301 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 MPPED1O15442 326 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 IGHV3-9P01782 118 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 NPBWR2P48146 333 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 UCP3P55916 312 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 OR2B8PP59922 312 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ARG2P78540 354 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 Q3ZCU0 254 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNF766Q5HY98 468 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNF611Q8N823 705 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TMEM178AQ8NBL3 297 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 OR1J1Q8NGS3 322 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SLAMF9Q96A28 289 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 RARRES2Q99969 163 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TUBA4BQ9H853 241 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 DMDP11532 3685 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 K7N7A8 449 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 FUT3P21217 361 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 RHEBQ15382 184 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 MCEMP1Q8IX19 187 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 APH1AQ96BI3 265 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 GPHA2Q96T91 129 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 IL36GQ9NZH8 169 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 IGSF23A1L1A6 192 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SSSCA1O60232 199 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 COX5BP10606 129 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 LMO1P25800 156 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 GNRHRP30968 328 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNF695Q8IW36 515 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SPSB4Q96A44 273 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 LIPGQ9Y5X9 500 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TRDCB7Z8K6 153 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ST8SIA5O15466 376 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNHIT1O43257 154 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 NXPH3O95157 252 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 CDS2O95674 445 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 EDN3P14138 238 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 NQO2P16083 231 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ATP6V0CP27449 155 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 PMELP40967 661 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 CEBPGP53567 150 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 CCL20P78556 96 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNF266Q14584 549 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 OR8B8Q15620 311 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 LFNGQ8NES3 379 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TECTBQ96PL2 329 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 MED13Q9UHV7 2174 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 HSPB6O14558 160 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 C3AR1Q16581 482 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 VASH2Q86V25 355 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms