RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TMED6	Q8WW62	240 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM106A	Q96A25	262 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	SEH1L	Q96EE3	360 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	INIP	Q9NRY2	104 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	SNX12	Q9UMY4	172 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	MYCBP2	O75592	4640 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	OR2AT4	A6NND4	320 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP6V0E1	O15342	81 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	FGF16	O43320	207 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TPST2	O60704	377 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	UMPS	P11172	480 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	PSG1	P11464	419 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF823	P16415	610 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	SERPINB5	P36952	375 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	PPT1	P50897	306 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TCTA	P57738	103 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	DSTN	P60981	165 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	HERV-K104	P61576	105 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	EMX2	Q04743	252 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	GAGE5	Q13069	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	GAGE6	Q13070	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	FHL2	Q14192	279 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	LCN8	Q6JVE9	175 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	WDR86	Q86TI4	376 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	GPR148	Q8TDV2	347 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	LIPH	Q8WWY8	451 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	NSL1	Q96IY1	281 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	PANX1	Q96RD7	426 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TUBA4B	Q9H853	241 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF222	Q9UK12	451 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	EMCN	Q9ULC0	261 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	HHLA2	Q9UM44	414 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	COX11	Q9Y6N1	276 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234		I3L521	148 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	CCS	O14618	274 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	RTL8C	O15255	209 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	RER1	O15258	196 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	DFFB	O76075	338 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	SERPINA3	P01011	423 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	IGLV1-51	P01701	117 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHG4	P01861	327 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	ACSM4	P0C7M7	580 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	CTLA4	P16410	223 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	CCL3L1	P16619	93 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	GAL	P22466	123 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	CD24	P25063	80 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	PSMB8	P28062	276 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	HTR1D	P28221	377 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	AQP2	P41181	271 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	PRRX1	P54821	245 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	PLTP	P55058	493 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	DLX6	P56179	175 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	HIST1H3A	P68431	136 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TAF13	Q15543	124 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	TTC23	Q5W5X9	447 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRIM25-208	ENST00000574234	C8orf74	Q6P047	294 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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