RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 Q5PR19 223 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF880Q6PDB4 577 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 Q8N402 240 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 OR52I2Q8NH67 350 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 RAB39BQ96DA2 213 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 ANAPC10Q9UM13 185 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-210ENST00000568388 RBBP9O75884 186 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 NDUFB7P17568 137 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 GLIPR1P48060 266 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 DGCR2P98153 550 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CR1LQ2VPA4 569 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 Q6ZS49 121 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC32Q9BV29 185 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CLN8Q9UBY8 286 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 KIF25Q9UIL4 384 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ODAMA1E959 279 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ECDO95905 644 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 FCGR3AP08637 254 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 NAT1P18440 290 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 HOGA1Q86XE5 327 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 FGFRL1Q8N441 504 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CORO2AQ92828 525 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 NARFLQ9H6Q4 476 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 Q9N2K0 584 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 MED13LQ71F56 2210 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 MEIKINA0A087WXM9 373 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 A0A096LNT2 108 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 A8MXK9 166 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 USF1P22415 310 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 EDDM3BP56851 147 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 GNB2P62879 340 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 EDDM3AQ14507 147 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ESCO2Q56NI9 601 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 Q6ZPA2 131 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 MOB1BQ7L9L4 216 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 OR4K15Q8NH41 348 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 C8orf46Q8TAG6 207 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 DCTN5Q9BTE1 182 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 OR6C3Q9NZP0 311 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 KLK11Q9UBX7 282 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 hADV38S2A0JD32 116 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ORC5O43913 435 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 HEXAP06865 529 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CGB3P0DN86 165 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CGB7P0DN87 165 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 GZMHP20718 246 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 RCVRNP35243 200 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ACTBP60709 375 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ACTG1P63261 375 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 BAK1Q16611 211 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CD276Q5ZPR3 534 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 TPRX1Q8N7U7 411 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM63Q969Q1 353 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ING3Q9NXR8 418 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 HIVEP1P15822 2718 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 J3QRK9 145 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 LANCL1O43813 399 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 RPL31P62899 125 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 C6orf183Q5T699 404 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 BTN2A1Q7KYR7 527 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 GVQW1Q8N7I0 195 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF565Q8N9K5 539 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 LY6G5BQ8NDX9 201 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC107Q8WV48 283 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 C1orf159Q96HA4 380 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF286AQ9HBT8 521 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 IFT46Q9NQC8 304 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 OPN4Q9UHM6 478 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms