RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPB6O14558 160 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 MGST3O14880 152 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2H2O95918 312 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBP4P02753 201 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OPN1MWP04001 364 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 HCKP08631 526 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF44P15621 663 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYL12AP19105 171 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRKACBP22694 351 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDK2P24941 298 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNFSF8P32971 234 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLIPR1P48060 266 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 AESQ08117 197 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHL22Q53GT1 634 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBLN7Q53RD9 439 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q8IYB0 196 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CFHR4Q92496 578 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 MALSU1Q96EH3 234 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 PELI1Q96FA3 418 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 HHLA2Q9UM44 414 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTDSP2O14595 271 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH2D1BO14796 132 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL1AP01583 271 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHV3-7P01780 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM225BP0DP42 221 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPEP16870 476 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFYBP25208 207 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLP1RP43220 463 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR3A4PP47883 348 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 BLCAPP62952 87 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFA5Q16718 116 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 UTF1Q5T230 341 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 C11orf88Q6PI97 169 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 UTS2BQ765I0 119 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPSB1Q96BD6 273 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALG8Q9BVK2 526 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLS2Q9UI32 602 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ODAMA1E959 279 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 E9PI62 339 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 RGS5O15539 181 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCNKO75909 580 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 KDM4BO94953 1096 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDRT1O95170 752 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 HTR1DP28221 377 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTGFRP43088 359 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOX2P48431 317 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB40BQ12829 278 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF146Q15072 292 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 LTC4SQ16873 150 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-212ENST00000567690 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms