RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 GALNT14Q96FL9 552 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 CHIAQ9BZP6 476 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR2J1Q9GZK6 312 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR51E2Q9H255 320 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 RNF167Q9H6Y7 350 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 TAF9BQ9HBM6 251 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 THYN1Q9P016 225 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 SCML2Q9UQR0 700 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 V9GYH0 126 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 NUP205Q92621 2012 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.69□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR5H15A6NDH6 313 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 IFITM5A6NNB3 132 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 B5MCH6 92 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 E7EQ34 232 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 F5H5K5 113 aa4.69□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 NRASP01111 189 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PTHP01270 115 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 IGLV3-27P01718 113 aa4.69□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 UMODP07911 640 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PIRTP0C851 137 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PIPP12273 146 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 BCKDHAP12694 445 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 CR2P20023 1033 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 GATA3P23771 443 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 MYL9P24844 172 aa4.69□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 ACVRL1P37023 503 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR3A2P47893 321 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H3AP68431 136 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 H3F3AP84243 136 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 CLINT1Q14677 625 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PEA15Q15121 130 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF284Q2VY69 593 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 NXNL2Q5VZ03 156 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 FBXL22Q6P050 247 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.69□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 TMEM86BQ8N661 226 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 GATD1Q8NB37 220 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR8D4Q8NGM9 314 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR4F5Q8NH21 305 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR51Q1Q8NH59 317 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 FGGYQ96C11 551 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 DIRAS2Q96HU8 199 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 IL17FQ96PD4 163 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 GPER1Q99527 375 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 MGLLQ99685 303 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 COMMD3Q9UBI1 195 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 NAT8Q9UHE5 227 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 SLC7A7Q9UM01 511 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 COX11Q9Y6N1 276 aa4.69□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 TRAV24A0A0B4J272 114 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0G2JLM5 398 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1B0GX51 115 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 LILRA5A6NI73 299 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 COLCA2A8K830 154 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 IDSB3KWA1 339 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 D6RAR5 112 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 TNFRSF11BO00300 401 aa4.68□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 MFNGO00587 321 aa4.68□□□□□ -1.66
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