RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 DLGAP1O14490 977 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 TYROBPO43914 113 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SERPINA1P01009 418 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 CST4P01036 141 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 IGHV3-11P01762 117 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 AMBPP02760 352 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 CD14P08571 375 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 P0DMU3 169 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 FAM231AP0DMU4 169 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 FAM231CP0DMU5 169 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 CDK2P24941 298 aa2.69□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 AQP1P29972 269 aa2.69□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 RBM34P42696 430 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 GPM6AP51674 278 aa2.69□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 PRRX1P54821 245 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 EDDM3BP56851 147 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SYNJ2BPP57105 145 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 CDK6Q00534 326 aa2.69□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 PVRIGQ6DKI7 326 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 OR52W1Q6IF63 320 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 REEP3Q6NUK4 255 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 DRAM2Q6UX65 266 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 HEPN1Q6WQI6 88 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 KRT74Q7RTS7 529 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 PRSS45Q7RTY3 260 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 MICU2Q8IYU8 434 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SLC35F6Q8N357 371 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 OR2K2Q8NGT1 345 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 OR51A7Q8NH64 312 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 TMEM239Q8WW34 195 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SNAPC3Q92966 411 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SPTSSAQ969W0 71 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 RPEQ96AT9 228 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 C17orf77Q96MU5 243 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 TMEM38AQ9H6F2 299 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 OPA3Q9H6K4 179 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 PLEKHA1Q9HB21 404 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 HES4Q9HCC6 221 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 GRHPRQ9UBQ7 328 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 B9D1Q9UPM9 204 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SLC22A13Q9Y226 551 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 POLR1DQ9Y2S0 133 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 MPC1Q9Y5U8 109 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 LINC00312Q9Y6C7 94 aa2.69□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 CBY3A6NI87 242 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 ANXA2P2A6NMY6 339 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 ZNF732B4DXR9 585 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 C11orf94C9JXX5 98 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 M0QX08 132 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 TOR1AO14656 332 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 XRCC2O43543 280 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 MPZL2O60487 215 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SERPINB7O75635 380 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 IL1AP01583 271 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 CD74P04233 296 aa2.68□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 OR1E2P47887 323 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 PRKXP51817 358 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 FADDQ13158 208 aa2.68□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 DEFB114Q30KQ6 69 aa2.68□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 CCDC153Q494R4 210 aa2.68□□□□□ -1.98
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HERC1-211ENST00000560983 C4orf33Q8N1A6 199 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 BATF2Q8N1L9 274 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 TMEM104Q8NE00 496 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 PIGCQ92535 297 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 CORO2AQ92828 525 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 TOMM40LQ969M1 308 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 REEP6Q96HR9 211 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 PPP1R36Q96LQ0 422 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 RASL11BQ9BPW5 248 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 GPR173Q9NS66 373 aa2.68□□□□□ -1.98
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