RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 RAB22AQ9UL26 194 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 COL7A1Q02388 2944 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0B4J203 849 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GVG6 124 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 OOEPA6NGQ2 149 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 A6NIN4 97 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 OR5B21A6NL26 309 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 DVL1O14640 695 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 MLNRO43193 412 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 XRCC3O43542 346 aa7.56□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.56□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.56□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 CST11Q9H112 138 aa7.56□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 GGT3PA6NGU5 568 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 CHRM2P08172 466 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 IL7P13232 177 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 LMO1P25800 156 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ATP1B3P54709 279 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 P2RY14Q15391 338 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 STEAP3Q658P3 488 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 Q8N402 240 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ABHD1Q96SE0 405 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 TM2D1Q9BX74 207 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 DIABLOQ9NR28 239 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 GPR173Q9NS66 373 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 GABARAPH6UMI1 98 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 RAB27BO00194 218 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 SULT1C2O00338 296 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 AKR7A2O43488 359 aa7.54□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 CDK2P24941 298 aa7.54□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 CD200P41217 278 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 OR3A4PP47883 348 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 DEFA1P59665 94 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 DEFA3P59666 94 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP10-11P60412 298 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 SCN1BQ07699 218 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PRDX4Q13162 271 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 MAB21L1Q13394 359 aa7.54□□□□□ -1.2
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SMAD3-215ENST00000560424 ASAH1Q13510 395 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ARL6IP1Q15041 203 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 OXA1LQ15070 435 aa7.54□□□□□ -1.2
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