RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557092.5

NEDD1-209, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-209ENST00000557092 MUL1Q969V5 352 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 KIRREL1Q96J84 757 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 A0A087X0M5 115 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 A0A1B0GX30 115 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 A0A1W2PP11 408 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 PEX14O75381 377 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 IL1AP01583 271 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MAS1P04201 325 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CSF1P09603 554 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 GTF2F2P13984 249 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CD24P25063 80 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 OR9G1Q8NH87 305 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 NEK7Q8TDX7 302 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 WIPF1O43516 503 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 IGHV3-7P01780 117 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CGB3P0DN86 165 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CGB7P0DN87 165 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 PAX5Q02548 391 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 DOC2BQ14184 412 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 GPR176Q14439 515 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MPV17LQ2QL34 196 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 UTF1Q5T230 341 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 AWAT2Q6E213 333 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 Q8N2B8 174 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 RFESDQ8TAC1 157 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 DERL3Q96Q80 235 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MND1Q9BWT6 205 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MMP28Q9H239 520 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 IFT22Q9H7X7 185 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 PTGES3LE9PB15 166 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 CD1AP06126 327 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 CDK1P06493 297 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 SSTR5P35346 364 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 AQP4P55087 323 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 BLCAPP62952 87 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 THRSPQ92748 146 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 LEAP2Q969E1 77 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 MYDGFQ969H8 173 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 OR5M11Q96RB7 305 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 SCN3BQ9NY72 215 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 KCNAB3O43448 404 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 FBXO24O75426 580 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 MNDAP41218 407 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 GNG10P50151 68 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 DEFA6Q01524 100 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 NRG4Q8WWG1 115 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 CFHR4Q92496 578 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 TOMM40LQ969M1 308 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 RPEQ96AT9 228 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 OOSP1A8MZH6 123 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 J3QR06 171 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 PIN1P1O15428 100 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 Q6ZS46 218 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 CDH26Q8IXH8 852 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC107Q8WV48 283 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 PSG11Q9UQ72 335 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 VWFP04275 2813 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 LY6LH3BQJ8 138 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 RNLSQ5VYX0 342 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 LYG1Q8N1E2 194 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 TMED9Q9BVK6 235 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD1-209ENST00000557092 BANF2Q9H503 90 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms