RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	EDDM3A	Q14507	147 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	P2RY14	Q15391	338 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PIGY	Q3MUY2	71 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	AWAT2	Q6E213	333 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OR10K2	Q6IF99	312 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	DPF1	Q92782	380 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	FAM46B	Q96A09	425 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	C10orf35	Q96D05	121 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	B9D2	Q9BPU9	175 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PKIB	Q9C010	78 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		A0A087WXM4	84 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688		A0A0B4J203	849 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	C17orf98	A8MV24	154 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	GPX5	O75715	221 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	HAND1	O96004	215 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ARG1	P05089	322 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ZNF44	P15621	663 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CD36	P16671	472 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	FST	P19883	344 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	COX7A1	P24310	79 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MPZ	P25189	248 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PRDX2	P32119	198 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	RAB13	P51153	203 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	BLCAP	P62952	87 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MXD1	Q05195	221 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	RSU1	Q15404	277 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SSX2	Q16385	188 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	HES5	Q5TA89	166 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ZNF529	Q6P280	563 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	GFI1	Q99684	422 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	BANF2	Q9H503	90 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TMEM82	A0PJX8	343 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ODF3B	A8MYP8	253 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SC5D	O75845	299 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	KDM4B	O94953	1096 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TK1	P04183	234 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CD1A	P06126	327 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	UCHL1	P09936	223 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	SRM	P19623	302 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	GABRR1	P24046	479 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MYL9	P24844	172 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PAX6	P26367	422 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PTGFR	P43088	359 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	EDDM3B	P56851	147 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	KRTAP10-11	P60412	298 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ERVK11-1	P61568	191 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	PLA2G7	Q13093	441 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	ZNF626	Q68DY1	528 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	TMEM219	Q86XT9	240 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	FCGR1B	Q92637	280 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CS-233	ENST00000552688	S100A13	Q99584	98 aa		5.49	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms