RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CPOQ8IVL8 374 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OLIG1Q8TAK6 271 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RLIMQ9NVW2 624 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ST8SIA3O43173 380 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CTSVO60911 334 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MAS1P04201 325 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 AADACP22760 399 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TGFBR1P36897 503 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CAMPP49913 170 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SRPXP78539 464 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TCF15Q12870 199 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CRMP1Q14194 572 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MEP1BQ16820 701 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SBSNQ6UWP8 590 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR2T10Q8NGZ9 312 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RNF128Q8TEB7 428 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TSLPQ969D9 159 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ALG14Q96F25 216 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RNF122Q9H9V4 155 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA1BQ00975 2339 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM233B4DJY2 109 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SPINT2O43291 252 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPB7O75200 414 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-DOBP13765 273 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RBX1P62877 108 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TRNP1Q6NT89 227 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IGF2-ASQ6U949 168 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR5AK2Q8NH90 309 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SEC22AQ96IW7 307 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 B9A039 149 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FCN3O75636 299 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-34P06331 123 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KIR2DS1Q14954 304 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZSR9 355 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PATE1Q8WXA2 126 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35A4Q96G79 324 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 KRASP01116 189 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SEMG1P04279 462 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ATP1B1P05026 303 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR4A8P0C604 315 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ANOS1P23352 680 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HTR6P50406 440 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IER5LQ5T953 404 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 CLECL1Q8IZS7 167 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MAL2Q969L2 176 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PARLQ9H300 379 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IFITM10A6NMD0 228 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TAPBPO15533 448 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KLF4O43474 513 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 KCNMB1Q16558 191 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MED29Q9NX70 200 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 THYN1Q9P016 225 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1456Q9P272 454 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KLK13Q9UKR3 277 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FGF17O60258 216 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MPIG6BO95866 241 aa5.55□□□□□ -1.52
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