RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539305.1

AP002991.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP002991.1, Length 574 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002991.1-201ENST00000539305 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 JAM3Q9BX67 310 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 ING4Q9UNL4 249 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 DHDHQ9UQ10 334 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 FUOMA2VDF0 154 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 TMEM212A6NML5 194 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 C15orf65H3BRN8 121 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 IL1AP01583 271 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 CD33P20138 364 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 RAB3AP20336 220 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 REG1BP48304 166 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 MTNR1BP49286 362 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 CCDC107Q8WV48 283 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 DUX3Q96PT4 197 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 RHOFQ9HBH0 211 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP002991.1-201ENST00000539305 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 A0A1W2PPK0 400 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 SLC31A2O15432 143 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 OGG1O15527 345 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 PF4V1P10720 104 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 CEACAM3P40198 252 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 VHLP40337 213 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF134P52741 427 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 RSU1Q15404 277 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 REC114Q7Z4M0 266 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 OSR2Q8N2R0 312 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 TOMM40LQ969M1 308 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 RPEQ96AT9 228 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 Q96MT0 163 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 GPER1Q99527 375 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 PSMB11A5LHX3 300 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 SNTNA6NMZ2 147 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 OOSP1A8MZH6 123 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 MPZL2O60487 215 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 IGKV1D-33P01593 117 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 IGKV1-33P01594 117 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 MT-ND4P03905 459 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 ALDOBP05062 364 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 CCDC159P0C7I6 412 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 FAM106CPP0CH98 169 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 SERPINA2P20848 420 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 MNDAP41218 407 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 PAX5Q02548 391 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 EBI3Q14213 229 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 HES1Q14469 280 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 IL13RA2Q14627 380 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 KLHL22Q53GT1 634 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 MOB3BQ86TA1 216 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 LYPD6Q86Y78 171 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 Q8N6K4 173 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 OR52N1Q8NH53 320 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 GPR148Q8TDV2 347 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002991.1-201ENST00000539305 GGHQ92820 318 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms