RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 IFITM3Q01628 133 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCL15Q16663 113 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZIC4Q8N9L1 334 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 GTSF1Q8WW33 167 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 GINS3Q9BRX5 216 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 EBPLQ9BY08 206 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 MARCH5Q9NX47 278 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNF7Q9UBF6 113 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 CHD1O14646 1710 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 MYH3P11055 1940 aa4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 PGPA6NDG6 321 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 EPM2AB3EWF7 344 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 HIST1H3AP68431 136 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 H3F3AP84243 136 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 SPCS2Q15005 226 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 IRF4Q15306 451 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 BRMS1LQ5PSV4 323 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF550Q7Z398 422 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 KLK6Q92876 244 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 ASTN1O14525 1302 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIF15Q9NS87 1388 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 MYBPHLA2RUH7 354 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 KLLNB2CW77 178 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 M0QYV0 167 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAAHO00519 579 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 PEX7O00628 323 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 BHLHE40O14503 412 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 NDUFA2O43678 99 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 MFSD11O43934 449 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 TFPTP0C1Z6 253 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM228BP0C875 321 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADIGQ0VDE8 80 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 C6orf120Q7Z4R8 191 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 BMFQ96LC9 184 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 F2RL3Q96RI0 385 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR51B4Q9Y5P0 310 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.09□□□□□ -1.75
CSNK1G3-210ENST00000521364 GRIN2BQ13224 1484 aa4.09□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCN5AQ14524 2016 aa4.09□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.09□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 UPK2O00526 184 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPR75O95800 540 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 AMBPP02760 352 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 BGLAPP02818 100 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR13C7P0DN81 318 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZBTB25P24278 435 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 CRADDP78560 199 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 TCEAL5Q5H9L2 206 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR52L1Q8NGH7 329 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR51A2Q8NGJ7 313 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR52P1PQ8NH57 321 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 TCEAL3Q969E4 200 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 AIF1LQ9BQI0 150 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 PQLC2LA1A4F0 135 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 UPK1AO00322 258 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 HBZP02008 142 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 TTRP02766 147 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 FGF6P10767 208 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 NSDHLQ15738 373 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 STX19Q8N4C7 294 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR10A6Q8NH74 314 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR10G6Q8NH81 332 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 MCFD2Q8NI22 146 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF778Q96MU6 729 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 WFDC1Q9HC57 220 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 POMPQ9Y244 141 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 B8ZZF3 427 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 D6RAR5 112 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 IGHV3-23P01764 117 aa4.08□□□□□ -1.76
CSNK1G3-210ENST00000521364 IL3RAP26951 378 aa4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.1 ms