RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517028.1

RN7SKP99-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 99, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP99, Length 307 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP99-201ENST00000517028 OMGP23515 440 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 GADD45AP24522 165 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 MPZP25189 248 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 HTR2CP28335 458 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 CEACAM3P40198 252 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 GNG10P50151 68 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 DLX1P56177 255 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 P2RX3P56373 397 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 BPIFB3P59826 476 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 SLC35A2P78381 396 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 BDH1Q02338 343 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 ARFRP1Q13795 201 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 HES1Q14469 280 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 SSX2Q16385 188 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 LCE4AQ5TA78 99 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 C22orf42Q6IC83 251 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 RAB12Q6IQ22 244 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 KIR3DL3Q8N743 410 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 SUMF2Q8NBJ7 301 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR4S1Q8NGB4 309 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR10X1Q8NGY0 326 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 MRGPRDQ8TDS7 321 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 SGCDQ92629 289 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 UPRTQ96BW1 309 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 C20orf173Q96LM9 149 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 DERL3Q96Q80 235 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 DUSP21Q9H596 190 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 GNG12Q9UBI6 72 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 KIF25Q9UIL4 384 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 A0A087WXM4 84 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 A0A0G2JK05 382 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 A0A0U1RQK1 487 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 ODAMA1E959 279 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 DENRO43583 198 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 CLPXO76031 633 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 VENTXO95231 258 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 TNFAIP8O95379 198 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 CD3GP09693 182 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 CPEP16870 476 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 RAB3BP20337 219 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 PRTN3P24158 256 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 CDK2P24941 298 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 IL3RAP26951 378 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 GABRA5P31644 462 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 BRS3P32247 399 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 SAA4P35542 130 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 MNDAP41218 407 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR3A1P47881 315 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 GLIPR1P48060 266 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 UBE2E1P51965 193 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 RBM11P57052 281 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 INSL4Q14641 139 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 MPV17LQ2QL34 196 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 C6orf183Q5T699 404 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 FAM27D1Q5T7N8 215 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZNF773Q6PK81 442 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 LINC00596Q86U02 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 STPG3Q8N7X2 389 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 PXT1Q8NFP0 134 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 TSPAN14Q8NG11 270 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR6M1Q8NGM8 313 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR4K15Q8NH41 348 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 RFESDQ8TAC1 157 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 UBALD1Q8TB05 177 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZNF596Q8TC21 504 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 IL1F10Q8WWZ1 152 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 PHYHIPQ92561 330 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 ARL11Q969Q4 196 aa4.54□□□□□ -1.68
RN7SKP99-201ENST00000517028 TBX15Q96SF7 602 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms