RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 SP6Q3SY56 376 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-205ENST00000514178 GALNT10Q86SR1 603 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-205ENST00000514178 APOL4Q9BPW4 351 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-205ENST00000514178 ASCL3Q9NQ33 180 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-205ENST00000514178 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
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PGGT1B-205ENST00000514178 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa4.57□□□□□ -1.68
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PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV2D-28P01615 120 aa4.56□□□□□ -1.68
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PGGT1B-205ENST00000514178 C10orf107Q8IVU9 208 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-205ENST00000514178 OSR2Q8N2R0 312 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-205ENST00000514178 YPEL4Q96NS1 127 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC01587Q99440 93 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-205ENST00000514178 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-205ENST00000514178 HDHD2Q9H0R4 259 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-205ENST00000514178 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
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