RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 IL13RA2Q14627 380 aa13.41□□□□□ -0.26
HERC3-211ENST00000513325 PIGYQ3MUY2 71 aa13.41□□□□□ -0.26
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HERC3-211ENST00000513325 OR8H3Q8N146 312 aa13.38□□□□□ -0.27
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HERC3-211ENST00000513325 LIMS4P0CW20 117 aa13.37□□□□□ -0.27
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HERC3-211ENST00000513325 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.37□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 OR2W3Q7Z3T1 314 aa13.37□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 APH1BQ8WW43 257 aa13.37□□□□□ -0.27
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HERC3-211ENST00000513325 HSD17B6O14756 317 aa13.36□□□□□ -0.27
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HERC3-211ENST00000513325 C11orf87Q6NUJ2 197 aa13.36□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 SLC35E3Q7Z769 313 aa13.36□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 MOB3BQ86TA1 216 aa13.36□□□□□ -0.27
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HERC3-211ENST00000513325 FAM118AQ9NWS6 357 aa13.36□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.35□□□□□ -0.27
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HERC3-211ENST00000513325 LINC01548A6NM66 108 aa13.35□□□□□ -0.27
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 REG1BP48304 166 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 RBM11P57052 281 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 SLC35B1P78383 322 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 DDI2Q5TDH0 399 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 OR52N1Q8NH53 320 aa13.35□□□□□ -0.27
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