RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	AQP3	Q92482	292 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ACY3	Q96HD9	319 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FAM206A	Q9NX38	181 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0G2JMZ2	1700 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf80	F5H4A9	247 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PRRG2	O14669	202 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF737	O75373	536 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CDS2	O95674	445 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FCGR3A	P08637	254 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM11	P17152	192 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GAS1	P54826	345 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PSG4	Q00888	419 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RUNX1	Q01196	453 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NAAA	Q02083	359 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RTL8B	Q17RB0	113 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IGSF11	Q5DX21	431 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CORO2A	Q92828	525 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	DOCK7	Q96N67	2140 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SPINK4	O60575	86 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OPN1MW	P04001	364 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	GNB1	P62873	340 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TEX30	Q5JUR7	227 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	LYG1	Q8N1E2	194 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	FBXO17	Q96EF6	278 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SOST	Q9BQB4	213 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PRO1933	Q9H354	126 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0U1RQV5	110 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF98	A6NK75	572 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	AP4M1	O00189	453 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MFNG	O00587	321 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	RAMP1	O60894	148 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	IL3RA	P26951	378 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	BTC	P35070	178 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R45	P59539	299 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC29	Q8WV35	223 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PARP11	Q9NR21	331 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	WDR81	Q562E7	1941 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	HP	P00738	406 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	NAT1	P18440	290 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ID4	P47928	161 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	GNG10	P50151	68 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PRR32	B1ATL7	298 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TIAF1	O95411	115 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	EFEMP2	O95967	443 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	RAB5A	P20339	215 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR5B3	Q8NH48	314 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193		H3BQ15	152 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ERVFC1-1	P60608	527 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2V2	Q15819	145 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	YIF1A	O95070	293 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	GALR1	P47211	349 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SULT1A2	P50226	295 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ERVS71-1	P61550	626 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	DLK1	P80370	383 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	EFNB1	P98172	346 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ATP5S	Q99766	215 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	WDR54	Q9H977	334 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf202	A1L168	122 aa		7	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		7	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PSG2	P11465	335 aa		7	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PMEL	P40967	661 aa		7	□□□□□ -1.29

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