RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	OR5H8	P0DN80	308 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	CDKN1A	P38936	164 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	IKZF1	Q13422	519 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	ADIPOQ	Q15848	244 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	MSMP	Q1L6U9	139 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508		Q6ZS49	121 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	WDR86	Q86TI4	376 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	MUC15	Q8N387	334 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	OR8G5	Q8NG78	346 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM230	Q96A57	120 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF488	Q96MN9	340 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TMEM18-208	ENST00000497508	ARID1A	O14497	2285 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A0B4J2A0	478 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP6V1G1	O75348	118 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	OR4A8	P0C604	315 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	PGAM2	P15259	253 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	VAMP1	P23763	118 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	NUP37	Q8NFH4	326 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	IFT22	Q9H7X7	185 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	DECR2	Q9NUI1	292 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	RHBDL1	O75783	438 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	SFT2D2	O95562	160 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	NAPSA	O96009	420 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	GCH1	P30793	250 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFA5	Q16718	116 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	LIN54	Q6MZP7	749 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	NINJ1	Q92982	152 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	ITPR3	Q14573	2671 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	PLSCR5	A0PG75	271 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	PGA5	P0DJD9	388 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	SERPINF1	P36955	418 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	ERVK11-1	P61568	191 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508		Q6ZPA2	131 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	DTX2	Q86UW9	622 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	LRP11	Q86VZ4	500 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	SPERT	Q8NA61	448 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	PERP	Q96FX8	193 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	HMSD	A8MTL9	139 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508		H0YL77	283 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	MLNR	O43193	412 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	GLRA1	P23415	457 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	DUSP1	P28562	367 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF154	Q13106	437 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	BAMBI	Q13145	260 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	SYT3	Q9BQG1	590 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508		Q9N2K0	584 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GWJ7	208 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	DBX1	A6NMT0	343 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFS7	O75251	213 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	PI3	P19957	117 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	C4BPB	P20851	252 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	GLRX	P35754	106 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	GLP1R	P43220	463 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	GMFB	P60983	142 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508		Q6P435	159 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	NEK7	Q8TDX7	302 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TMEM18-208	ENST00000497508	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		12.3	□□□□□ -0.44

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