RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	GNMT	Q14749	295 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	GAPT	Q8N292	157 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	LHX6	Q9UPM6	363 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	CA6	P23280	308 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	SOX8	P57073	446 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522		Q6ZRG5	221 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522		J3QW42	95 aa		13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
CALD1-222	ENST00000495522	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522		J3QT63	122 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	HS3ST1	O14792	307 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	MEOX2	P50222	304 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522		Q3ZCU0	254 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	RDH5	Q92781	318 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	HSD17B6	O14756	317 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	SPINK2	P20155	84 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	CD82	P27701	267 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	TNFSF10	P50591	281 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	SPP1	P10451	314 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	UCP1	P25874	307 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	WNT2B	Q93097	391 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	RHBDL1	O75783	438 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	CD5	P06127	495 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	DANCR	P0C864	163 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	PMP22	Q01453	160 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	NHLH2	Q02577	135 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	VASH2	Q86V25	355 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522		H0Y980	276 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	AGPAT2	O15120	278 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	DEGS1	O15121	323 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	ADAM20	O43506	726 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF44	P15621	663 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	S100G	P29377	79 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	ID4	P47928	161 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	RAB13	P51153	203 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CALD1-222	ENST00000495522	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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