RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	AQP3	Q92482	292 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	LIME1	Q9H400	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A0G2JMP0	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A0X1KG70	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM210	A6NLX4	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717		F8VVB4	439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717		F8VWA3	439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717		H0YL77	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717		J3QRK9	145 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717		J3QT63	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	MFNG	O00587	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	HS3ST1	O14792	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	CA11	O75493	328 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	UPK1B	O75841	260 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	LHB	P01229	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SFTPB	P07988	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	CSF3	P09919	207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	DANCR	P0C864	163 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	CA6	P23280	308 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	CDK2	P24941	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	PMEL	P40967	661 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	GPM6A	P51674	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP1B3	P54709	279 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	PAX5	Q02548	391 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717		Q6ZPA2	131 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	GAPT	Q8N292	157 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	PIGC	Q92535	297 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	NRGN	Q92686	78 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717		A4D1N5	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SPINT2	O43291	252 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	SYNGR1	O43759	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	LANCL1	O43813	399 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DCTN1-222	ENST00000492717	PROP1	O75360	226 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms