RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF565Q8N9K5 539 aa22.16■■□□□ 1.14
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HOXB3-211ENST00000490677 LEAP2Q969E1 77 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 BARHL1Q9BZE3 327 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 ST3GAL6Q9Y274 331 aa22.16■■□□□ 1.14
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HOXB3-211ENST00000490677 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXB3-211ENST00000490677 OR52N1Q8NH53 320 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 GHSRQ92847 366 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXB3-211ENST00000490677 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 AKR1E2Q96JD6 320 aa22.14■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 OXLD1Q5BKU9 147 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 C10orf99Q6UWK7 81 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 OSR2Q8N2R0 312 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 METTL9Q9H1A3 318 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 OR10A7Q8NGE5 316 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 OR4F4Q96R69 305 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 Q499Y3 187 aa22.11■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 TOMM40LQ969M1 308 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 C15orf65H3BRN8 121 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINA2P20848 420 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 MNDAP41218 407 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 ST3GAL4Q11206 333 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 RIPK1Q13546 671 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 LTC4SQ16873 150 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 YIF1BQ5BJH7 314 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 LYPD6Q86Y78 171 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 DHRSXQ8N5I4 330 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 OR56B4Q8NH76 319 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 GNG10P50151 68 aa22.08■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 RCN1Q15293 331 aa22.08■■□□□ 1.13
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HOXB3-211ENST00000490677 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 WFDC9Q8NEX5 89 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 CAPSLQ8WWF8 208 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 OR14A2Q96R54 314 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 MOB4Q9Y3A3 225 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PPE3 182 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PRX2 142 aa22.07■■□□□ 1.12
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