RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 LYNX1G3V0Z9 82 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 UBXN8O00124 270 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CLOCKO15516 846 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF13O43567 381 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 UGT2B11O75310 529 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 BANF1O75531 89 aa1.85□□□□□ -2.11
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RABGGTB-211ENST00000489450 OR56A5P0C7T3 313 aa1.85□□□□□ -2.11
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RABGGTB-211ENST00000489450 LYNX1P0DP58 116 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CPMP14384 443 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GABRA1P14867 456 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
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RABGGTB-211ENST00000489450 CDKN2DP55273 166 aa1.85□□□□□ -2.11
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RABGGTB-211ENST00000489450 BTN3A2P78410 334 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 BSPH1Q075Z2 132 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NNATQ16517 81 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 XKR7Q5GH72 579 aa1.85□□□□□ -2.11
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RABGGTB-211ENST00000489450 Q5W150 140 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 AGTRAPQ6RW13 159 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZYG11AQ6WRX3 759 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 C12orf54Q6X4T0 127 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXW12Q6X9E4 464 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GABRG1Q8N1C3 465 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF615Q8N8J6 731 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF709Q8N972 641 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 OR56B2PQ8NGI1 322 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 FNDC9Q8TBE3 224 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ASZ1Q8WWH4 475 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 S100PBPQ96BU1 408 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RASD2Q96D21 266 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NEURL3Q96EH8 262 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF681Q96N22 645 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR21Q99679 349 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SPIN2AQ99865 258 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 BEX2Q9BXY8 128 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 OR8D2Q9GZM6 311 aa1.85□□□□□ -2.11
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RABGGTB-211ENST00000489450 ANKHQ9HCJ1 492 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TMED5Q9Y3A6 229 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 WNK2Q9Y3S1 2297 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 APOBP04114 4563 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PKHD1P08F94 4074 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 COLCA2A8K830 154 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 HACD1B0YJ81 288 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA8MH3BSY2 632 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 H7C0C1 242 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 AIM2O14862 343 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CTNSO60931 367 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXH1O75593 365 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1D-16P01601 117 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 APOC2P02655 101 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ACSM4P0C7M7 580 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MPC1LP0DKB6 136 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RALBP11234 206 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB3BP20337 219 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NPY1RP25929 384 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 DCKP27707 260 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP5OP48047 213 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TPM4P67936 248 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 DOC2AQ14183 400 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 HADHQ16836 314 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 BEX5Q5H9J7 111 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 THEM4Q5T1C6 240 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF684Q5T5D7 378 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXW9Q5XUX1 488 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 WDFY1Q8IWB7 410 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 KATNAL2Q8IYT4 538 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX31Q8N9S9 440 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR31Q8NA23 367 aa1.84□□□□□ -2.11
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