RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	KDM4B	O94953	1096 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CHRM2	P08172	466 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	PSG2	P11465	335 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GABRA2	P47869	451 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	OR3A4P	P47883	348 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	LGALS4	P56470	323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	MED30	Q96HR3	178 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	S100A13	Q99584	98 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	LYST	Q99698	3801 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344		A6NDX4	124 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CDRT1	O95170	752 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CALCB	P10092	127 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CD37	P11049	281 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	COX7A1	P24310	79 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GADD45A	P24522	165 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	LMO1	P25800	156 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	PRDX2	P32119	198 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	BLCAP	P62952	87 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CASC10	Q5T4H9	136 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	LYPD6	Q86Y78	171 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	METTL9	Q9H1A3	318 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	SIGLEC5	O15389	551 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	HTR3B	O95264	441 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	PRKACA	P17612	351 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	MYL9	P24844	172 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	CAV3	P56539	151 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	RSU1	Q15404	277 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	ELP2	Q6IA86	826 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	CD177	Q8N6Q3	437 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF222	Q9UK12	451 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	SHISA3	A0PJX4	238 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	PDCD5	O14737	125 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	MTNR1B	P49286	362 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	PSMD7	P51665	324 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	GPR176	Q14439	515 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	AWAT2	Q6E213	333 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344		Q8NFD4	153 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	MUC7	Q8TAX7	377 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	SDSL	Q96GA7	329 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	GFI1	Q99684	422 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344		V9GY05	133 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	F2RL2	O00254	374 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RBM3-208	ENST00000489344	SH2D1B	O14796	132 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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