RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482558.5

SNX13-208, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-208ENST00000482558 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ARPC5O15511 151 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SOCS1O15524 211 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SP1P08047 785 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 RRASP10301 218 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CXCL2P19875 107 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 KLK2P20151 261 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CLDN18P56856 261 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PSG4Q00888 419 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PLGLB1Q02325 96 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 FHL2Q14192 279 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SLC10A1Q14973 349 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 LPAL2Q16609 132 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 MICBQ29980 383 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 C6orf183Q5T699 404 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SPINK14Q6IE38 97 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZNF774Q6NX45 483 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZNF546Q86UE3 836 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZNF611Q8N823 705 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 TCEAL3Q969E4 200 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 APH1AQ96BI3 265 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PPA2Q9H2U2 334 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZFP57Q9NU63 452 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZNF175Q9Y473 711 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 A0A0A6YYD4 124 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 A0A1W2PN81 502 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 HELTA6NFD8 242 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 LEUTXA8MZ59 168 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 TNFSF15O95150 251 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SPDEFO95238 335 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SFT2D2O95562 160 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 MPC2O95563 127 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CST4P01036 141 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PMP2P02689 132 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 B4GALT1P15291 398 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 M6PRP20645 277 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SERPINA2P20848 420 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PSMB6P28072 239 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SSTR2P30874 369 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CHRNA7P36544 502 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ARPC4P59998 168 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 SORDQ00796 357 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 BAMBIQ13145 260 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PPP1R1AQ13522 171 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 HES3Q5TGS1 186 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 LINC00596Q86U02 117 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 DTX2Q86UW9 622 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 CMBLQ96DG6 245 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 NICN1Q9BSH3 213 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 PIGMQ9H3S5 423 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 BANF2Q9H503 90 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX13-208ENST00000482558 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.58□□□□□ -1.36
SNX13-208ENST00000482558 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.58□□□□□ -1.36
SNX13-208ENST00000482558 OR2AT4A6NND4 320 aa6.58□□□□□ -1.36
SNX13-208ENST00000482558 BCL2L11O43521 198 aa6.58□□□□□ -1.36
SNX13-208ENST00000482558 CSN2P05814 226 aa6.58□□□□□ -1.36
SNX13-208ENST00000482558 GLAP06280 429 aa6.58□□□□□ -1.36
SNX13-208ENST00000482558 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SNX13-208ENST00000482558 AKR1C4P17516 323 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1098.4 ms