RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 AP4S1Q9Y587 144 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 OOSP1A8MZH6 123 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 HSD17B6O14756 317 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 SLC31A2O15432 143 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 IGHG2P01859 326 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 MT-ND2P03891 347 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 ECI1P42126 302 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 GPR12P47775 334 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 FDX2Q6P4F2 183 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 CHST4Q8NCG5 386 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 CCDC107Q8WV48 283 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 LGALS12Q96DT0 336 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 CCRL2O00421 344 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 GABRPO00591 440 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 SULT1B1O43704 296 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 ZFPL1O95159 310 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 CDRT1O95170 752 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 SOX2P48431 317 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 Q8N9W7 124 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 RFKQ969G6 155 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 ORAI1Q96D31 301 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 AMBNQ9NP70 447 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 ZFP57Q9NU63 452 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 SCOCQ9UIL1 159 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 FGF16O43320 207 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 HTR3BO95264 441 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 MTNR1BP49286 362 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CCR9P51686 369 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 F2RL1P55085 397 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SLC35B1P78383 322 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR8H3Q8N146 312 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 Q8N6K4 173 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR5B12Q96R08 314 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GPER1Q99527 375 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ALG8Q9BVK2 526 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SORL1Q92673 2214 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PP11 408 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 LY86O95711 162 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RAB7AP51149 207 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 TMED1Q13445 227 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GPR50Q13585 617 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RSU1Q15404 277 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 XAF1Q6GPH4 301 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 TEX38Q6PEX7 206 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ABCG5Q9H222 651 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 KLK15Q9H2R5 256 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GNB4Q9HAV0 340 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ING4Q9UNL4 249 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 DHDHQ9UQ10 334 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 LYSTQ99698 3801 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 C15orf65H3BRN8 121 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms