RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 RFNGQ9Y644 331 aa12.01□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ECI1P42126 302 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 HNF4GQ14541 408 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ABHD17BQ5VST6 288 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 COMMD2Q86X83 199 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR2G3Q8NGZ4 309 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 PBOV1Q9GZY1 135 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 LHFPL6Q9Y693 200 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 RER1O15258 196 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 NTF4P34130 210 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 RAC1P63000 192 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 IL13RA2Q14627 380 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 FAM189A2Q15884 450 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF506Q5JVG8 444 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 THEM4Q5T1C6 240 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR5AS1Q8N127 324 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 GPR137CQ8N3F9 429 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 RNF133Q8WVZ7 376 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 R3HDM4Q96D70 268 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 TMEM242Q9NWH2 141 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 AKAP13Q12802 2813 aa12□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 MGAQ8IWI9 3026 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 GCGP01275 180 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 CLDN15P56746 228 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR10A2Q9H208 303 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 CDH20Q9HBT6 801 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 FAM166BA8MTA8 275 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 CXCL13O43927 109 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 FUT3P21217 361 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ATP6V0CP27449 155 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 SRD5A2P31213 254 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ASCL1P50553 236 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 GGNQ86UU5 652 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 AK3Q9UIJ7 227 aa11.99□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 CLDN34H7C241 214 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF20P17024 532 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 PCP4P48539 62 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 DECR2Q9NUI1 292 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 SRYQ05066 204 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR1C1Q15619 314 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 SP6Q3SY56 376 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR4X1Q8NH49 305 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ADGRG7Q96K78 797 aa11.98□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 DNAJC13O75165 2243 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ST8SIA3O43173 380 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 DFFBO76075 338 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 TMEM187Q14656 261 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 KLHL24Q6TFL4 600 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 PRSS33Q8NF86 280 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 HSF4Q9ULV5 492 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF878C9JN71 531 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 M0R143 59 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR5AC1P0C628 307 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 GABRR1P24046 479 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 CARD18P57730 90 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR1P1Q8NH06 330 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 REEP6Q96HR9 211 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 HPNP05981 417 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF17P17021 662 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 PIGPP57054 158 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 ZNF266Q14584 549 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 RAB35Q15286 201 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 HIST3H3Q16695 136 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR2M7Q8NG81 312 aa11.97□□□□□ -0.49
GPC1-208ENST00000469694 OR10D3Q8NH80 312 aa11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms