RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 TOP1MTQ969P6 601 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 RPEQ96AT9 228 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 FMC1Q96HJ9 113 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SMIM8Q96KF7 97 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 C11orf70Q9BRQ4 267 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 KIFC1Q9BW19 673 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM222Q9H0R3 208 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SMDT1Q9H4I9 107 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM38AQ9H6F2 299 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 FBXL3Q9UKT7 428 aa-1.04□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 DNAH2Q9P225 4427 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SIPA1L1O43166 1804 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ADGRB2O60241 1585 aa-1.04□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 NOS1P29475 1434 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PRD5 423 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PRF3 423 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PRM7 423 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 PGPA6NDG6 321 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 OR5K4A6NMS3 321 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ANKRD65E5RJM6 399 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 J3QT63 122 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 UPK1AO00322 258 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ITGB1BP1O14713 200 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 COX7A2P2O60397 106 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SCGB2A1O75556 95 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 IL1BP01584 269 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 IGLV3-1P01715 115 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 C1QAP02745 245 aa-1.05□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 OR4Q2P0C623 313 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 ATP6V1C1P21283 382 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 CLLU1OSQ5K130 101 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 Q86TA4 180 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 OR1L8Q8NGR8 309 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa-1.06□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PPE3 182 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 C9JQL5 133 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 H3BP45 60 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 K7EQS6 105 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 M0QXV9 152 aa-1.06□□□□□ -2.58
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