RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 C2orf74A8MZ97 194 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 M0R233 179 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SLC22A1O15245 554 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 UGT2B11O75310 529 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 NIPSNAP2O75323 286 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 OR2A4O95047 310 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 IGHG4P01861 327 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 HLA-DQA1P01909 254 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 PPBPP02775 128 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 OR9G9P0C7N8 305 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 FGF6P10767 208 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 AKT2P31751 481 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 PHBP35232 272 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CRYBB2P43320 205 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CYB561P49447 251 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 LCN6P62502 163 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ERVK-25P63136 954 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SLC7A9P82251 487 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SLC38A11Q08AI6 406 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 C17orf67Q0P5P2 114 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 RAB31Q13636 194 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 GNMTQ14749 295 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CDK10Q15131 360 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 P2RY14Q15391 338 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 TBC1D28Q2M2D7 210 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ODF4Q2M2E3 257 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 GALNTL6Q49A17 601 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 FAM106AQ4KMX7 169 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ACER2Q5QJU3 275 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SLC25A24Q6NUK1 477 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 C11orf63Q6NUN7 778 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 MED27Q6P2C8 311 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 AMTNQ6UX39 209 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC186Q7Z3E2 898 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SNX32Q86XE0 403 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CBLN2Q8IUK8 224 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC83Q8IWF9 413 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 STHQ8IWL8 128 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 NELFCDQ8IXH7 590 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 OR2L13Q8N349 312 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF781Q8N8C0 355 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CDRT4Q8N9R6 151 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 OR10X1Q8NGY0 326 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CNIH3Q8TBE1 160 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 MRGPRFQ96AM1 343 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SLAMF6Q96DU3 332 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ARL5BQ96KC2 179 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 AK8Q96MA6 479 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SMIM14Q96QK8 99 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 LYSMD1Q96S90 227 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SDF2Q99470 211 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SLF1Q9BQI6 1058 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM47Q9BQJ4 181 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 POLR3GLQ9BT43 218 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 DPEP2Q9H4A9 486 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 AUNIPQ9H7T9 357 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CXorf21Q9HAI6 301 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SYTL2Q9HCH5 934 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CTPS2Q9NRF8 586 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 HOMER3Q9NSC5 361 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 EHD2Q9NZN4 543 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 HACD3Q9P035 362 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 DEC1Q9P2X7 70 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CORO2BQ9UQ03 480 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CAMK2AQ9UQM7 478 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 KPTNQ9Y664 436 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 V9GYQ6 96 aa-1.28□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR5B21A6NL26 309 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 PPP5D1E7EU14 171 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 H3BML4 177 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 J3QRK9 145 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 GABRDO14764 452 aa-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.6 ms