RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VSIG4Q9Y279 399 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UFC1Q9Y3C8 167 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STRCQ7RTU9 1775 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A087X0M5 115 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1B0GX30 115 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NKX2-6A6NCS4 301 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM50BP56557 158 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD81P60033 236 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C10orf113Q5VZT2 155 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PGA4P0DJD7 388 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PGA5P0DJD9 388 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VSIG8P0DPA2 414 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GZMHP20718 246 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LGALS7P47929 136 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HERVK_113P61574 105 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM38BQ9NVV0 291 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNFSF18Q9UNG2 199 aa13.09□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNPH1O43598 174 aa13.08□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DLEC1Q9Y238 1755 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRSS12P56730 875 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAMTQ14353 236 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR5AU1Q8NGC0 362 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DPF1Q92782 380 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LPAR5Q9H1C0 372 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COA4Q9NYJ1 87 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLK13Q9UKR3 277 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM74A7A6NL05 159 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BRS3P32247 399 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM219AQ8IW50 185 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNX22Q96L94 193 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR54Q9H977 334 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CA11O75493 328 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV3-13P01766 116 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV3-7P01780 117 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRSS1P07477 247 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SOX8P57073 446 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WASHC3Q9Y3C0 194 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTRP02766 147 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCL1AP56279 114 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIGYQ3MUY2 71 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LYZL2Q7Z4W2 148 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR5A2Q8NGI9 324 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB24Q969Q5 203 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF665Q9H7R5 613 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF7Q9UBF6 113 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMPRSS2O15393 492 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR2M3Q8NG83 312 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SRD5A3Q9H8P0 318 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSPB8Q9UJY1 196 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FUT9Q9Y231 359 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 M0R296 226 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SFTPA2Q8IWL1 248 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SFTPA1Q8IWL2 248 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF122Q9H9V4 155 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PAGE4O60829 102 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DAOP14920 347 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 G6PCP35575 357 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAGEA5P43359 124 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C19orf57Q0VDD7 668 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST3H3Q16695 136 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMPD2O60906 423 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APCSP02743 223 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MOGAT3Q86VF5 341 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRGPRFQ96AM1 343 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NRTNQ99748 197 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB33BQ9H082 229 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HRKO00198 91 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDIPTO14735 213 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SSMEM1Q8WWF3 244 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 R4GN57 208 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSN3P07498 182 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PNLIPP16233 465 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZAR1Q86SH2 424 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HELTA6NFD8 242 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ISLRO14498 428 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GNG7O60262 68 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTP4A3O75365 173 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM255AQ5JRV8 349 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF383Q8NA42 475 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR5R1Q8NH85 324 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ASCL3Q9NQ33 180 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIPOXQ9P0Z9 390 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM157CP0CG43 387 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PSG2P11465 335 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms