RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.07□□□□□ -0.16
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FCN3O75636 299 aa14.04□□□□□ -0.16
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFA3P59666 94 aa14.04□□□□□ -0.16
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.04□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.04□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC107Q8WV48 283 aa14.04□□□□□ -0.16
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CD74P04233 296 aa14.03□□□□□ -0.16
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TOP3BP1-201ENST00000420768 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CORO2AQ92828 525 aa14.03□□□□□ -0.16
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.03□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.02□□□□□ -0.16
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CENPXA8MT69 81 aa14.02□□□□□ -0.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 FABP7O15540 132 aa14.02□□□□□ -0.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIRAS3O95661 229 aa14.02□□□□□ -0.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD3DP04234 171 aa14.02□□□□□ -0.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCER2P06734 321 aa14.02□□□□□ -0.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTXN2P0C2S0 81 aa14.02□□□□□ -0.17
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MEF2DQ14814 521 aa14.02□□□□□ -0.17
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