RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ZNF137PP52743 207 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 GGTLC2Q14390 218 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 FOXB1Q99853 325 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 B4E171 279 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CD160O95971 181 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 FABP2P12104 132 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 MYOGP15173 224 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SPINK2P20155 84 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 GFERP55789 205 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PTX4Q96A99 478 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.61□□□□□ -1.03
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HERC3-202ENST00000402738 UBE2CO00762 179 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SELEP16581 610 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 NMUP48645 174 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PSMB2P49721 201 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ZIC1Q15915 447 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PMCHL1Q16048 86 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 RTL10Q7L3V2 364 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SMIM12Q96EX1 92 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 MSGN1A6NI15 193 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 STAG3L2P0CL84 134 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CD46P15529 392 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CA6P23280 308 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 MFAP2P55001 183 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 FZD5Q13467 585 aa8.6□□□□□ -1.03
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HERC3-202ENST00000402738 TMEM140Q9NV12 185 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TBX21Q9UL17 535 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CYB561P49447 251 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 GNG3P63215 75 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CKAP5Q14008 2032 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PP11 408 aa8.6□□□□□ -1.03
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HERC3-202ENST00000402738 PATE4P0C8F1 98 aa8.6□□□□□ -1.03
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HERC3-202ENST00000402738 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ABHD3Q8WU67 409 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SMPD2O60906 423 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 VASH2Q86V25 355 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CARFQ8N187 725 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ASB10Q8WXI3 467 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GU03 582 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 HPRT1P00492 218 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ZNF32P17041 273 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 BTCP35070 178 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 OPRK1P41145 380 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 CAPZBP47756 277 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SERF2P84101 59 aa8.59□□□□□ -1.03
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HERC3-202ENST00000402738 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.59□□□□□ -1.03
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HERC3-202ENST00000402738 PSG2P11465 335 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TNFRSF9Q07011 255 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 EXT1Q16394 746 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 MENTQ9BUN1 341 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 NPTNQ9Y639 398 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 P01737 135 aa8.59□□□□□ -1.03
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