RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 GNB2P62879 340 aa14.52□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 LCN15Q6UWW0 184 aa14.52□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.52□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
GDE1-201ENST00000353258 CDS2O95674 445 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 LINC00614P0C842 121 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 MFAP5Q13361 173 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 PRSS8Q16651 343 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ZNF787Q6DD87 383 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 FUT9Q9Y231 359 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TNFSF12O43508 249 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 OPN1LWP04000 364 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 CEACAM1P13688 526 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 FAHP16930 419 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 GABREP78334 506 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ZP4Q12836 540 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 CARFQ8N187 725 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 Q96M66 194 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.52□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 B4E171 279 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TSPAN7P41732 249 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TAS2R30P59541 319 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ZNF573Q86YE8 665 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 H3BML4 177 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 CCKARP32238 428 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 OR6C1Q96RD1 312 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 DIRC2Q96SL1 478 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.51□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TRDCB7Z8K6 153 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TP53I11O14683 189 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 HLA-HP01893 362 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 LYZL4Q96KX0 146 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 CHST11Q9NPF2 352 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PPQ1 181 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 M0QZK8 103 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 IRF2P14316 349 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 BRICD5Q6PL45 260 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 DTX1Q86Y01 620 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ATP5SQ99766 215 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 RPRMQ9NS64 109 aa14.5□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 GALR1P47211 349 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 GUSBP11Q6P575 273 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ADAM20O43506 726 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ANGPTL7O43827 346 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 SHBQ15464 509 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 MOB3AQ96BX8 217 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 PGAM5Q96HS1 289 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ADAMTS20P59510 1910 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 WNT5AP41221 380 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 GNG10P50151 68 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 BAXQ07812 192 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 CARD17Q5XLA6 110 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 VSIRQ9H7M9 311 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 NAGKQ9UJ70 344 aa14.49□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 MUC3AQ02505 3323 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 H7BYZ3 331 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 CLRN1P58418 232 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 SSX7Q7RTT5 188 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 OR5B12Q96R08 314 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 RSG1Q9BU20 258 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.48□□□□□ -0.09
GDE1-201ENST00000353258 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms