RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 HLA-DRB3P79483 266 aa15.08■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 PCSK4Q6UW60 755 aa15.08■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 LRRC29Q8WV35 223 aa15.08■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 NMES1Q9C002 83 aa15.08■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 THBDP07204 575 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 CTXN2P0C2S0 81 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 OR5AC1P0C628 307 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 C4BPBP20851 252 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 GNRHRP30968 328 aa15.07■□□□□ 0
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ACTB-201ENST00000331789 TREM2Q9NZC2 230 aa15.07■□□□□ 0
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ACTB-201ENST00000331789 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 SPRY3O43610 288 aa15.07■□□□□ 0
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ACTB-201ENST00000331789 GLS2Q9UI32 602 aa15.07■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.07■□□□□ 0
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ACTB-201ENST00000331789 METRNQ9UJH8 293 aa15.06■□□□□ 0
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ACTB-201ENST00000331789 ICE1Q9Y2F5 2266 aa15.06■□□□□ 0
ACTB-201ENST00000331789 H7C1Q1 480 aa15.05■□□□□ 0
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ACTB-201ENST00000331789 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.05■□□□□ 0
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM108Q6UXF1 575 aa15.05■□□□□ -0
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ACTB-201ENST00000331789 CCL28Q9NRJ3 127 aa15.05■□□□□ -0
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ACTB-201ENST00000331789 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.05■□□□□ -0
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ACTB-201ENST00000331789 H0YIZ8 118 aa15.04■□□□□ -0
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ACTB-201ENST00000331789 GPHA2Q96T91 129 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 SUCNR1Q9BXA5 334 aa15.04■□□□□ -0
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ACTB-201ENST00000331789 IFNA7P01567 189 aa15.04■□□□□ -0
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