RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299543.8

CTDP1-202, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CTDP1, Length 3,380 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-202ENST00000299543 TCN2P20062 427 aa11.62□□□□□ -0.55
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CTDP1-202ENST00000299543 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 ESPL1Q14674 2120 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 H0YL77 283 aa11.62□□□□□ -0.55
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CTDP1-202ENST00000299543 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
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CTDP1-202ENST00000299543 HIST1H2BLQ99880 126 aa11.61□□□□□ -0.55
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CTDP1-202ENST00000299543 SNCAP37840 140 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 SULT1A2P50226 295 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 MLF1P58340 268 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 RAB4BP61018 213 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 HMGN3Q15651 99 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF611Q8N823 705 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 YPEL4Q96NS1 127 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 SVILO95425 2214 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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CTDP1-202ENST00000299543 SYT3Q9BQG1 590 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 NDUFAF3Q9BU61 184 aa11.6□□□□□ -0.55
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CTDP1-202ENST00000299543 CRYGSP22914 178 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 FAM3AP98173 230 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 ELOBQ15370 118 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 VASH2Q86V25 355 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.59□□□□□ -0.55
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CTDP1-202ENST00000299543 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDP1-202ENST00000299543 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.59□□□□□ -0.55
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