RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 TLNRD1Q9H1K6 362 aa16.39■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 PARP11Q9NR21 331 aa16.39■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 DLL3Q9NYJ7 618 aa16.39■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 AGPAT2O15120 278 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CDS2O95674 445 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SOX8P57073 446 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 NHLH2Q02577 135 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SWI5Q1ZZU3 235 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 ARV1Q9H2C2 271 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SMPD2O60906 423 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 ZNF44P15621 663 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 IGHV1-2P23083 117 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CCL11P51671 97 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 RTL8AQ9BWD3 113 aa16.38■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 DEGS1O15121 323 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 TNFSF12O43508 249 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 LYZL6O75951 148 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 F12P00748 615 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 F2RL1P55085 397 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 ERVS71-1P61550 626 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 PCSK4Q6UW60 755 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 NRIP2Q9BQI9 281 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CACNA1HO95180 2353 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 ADAM20O43506 726 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CD82P27701 267 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 PPP1CBP62140 327 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 HLA-DRB3P79483 266 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 PIP4P1Q86T03 277 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 WDR86Q86TI4 376 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 DEFB124Q8NES8 71 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SPIN2AQ99865 258 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SEC11CQ9BY50 192 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CDH20Q9HBT6 801 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CLCF1Q9UBD9 225 aa16.37■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 Q6P435 159 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CMTM1Q8IZ96 169 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 TRIB1Q96RU8 372 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 GINS3Q9BRX5 216 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 OR8U9P0C7N5 309 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 UCP1P25874 307 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 TGFBR3Q03167 851 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 ZNF880Q6PDB4 577 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CLRN3Q8NCR9 226 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 OR8U1Q8NH10 309 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 OR10J5Q8NHC4 309 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 BOD1Q96IK1 185 aa16.36■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SEC11BP0C7V7 166 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 FTH1P19P0C7X4 201 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 ASCL1P50553 236 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 TMEM88Q6PEY1 159 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SCCPDHQ8NBX0 429 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 KIRREL1Q96J84 757 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 MAGT1Q9H0U3 335 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 IFT22Q9H7X7 185 aa16.35■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 LRP5LA4QPB2 252 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 FAM24AA6NFZ4 105 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 J3QW42 95 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 TOR1AO14656 332 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SSSCA1O60232 199 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 WISP2O76076 250 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SPP1P10451 314 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 OR2C3Q8N628 320 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SH3BGRL3Q9H299 93 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 GLRX2Q9NS18 164 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 FRYQ5TBA9 3013 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 TRAV39A0A0B4J263 110 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SIRPB1O00241 398 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 IGHG3P01860 377 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SFTA3P0C7M3 94 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CD80P33681 288 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 NMSQ5H8A3 153 aa16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP21-201ENST00000289865 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms