RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 HBE1P02100 147 aa16.06■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 RNF224P0DH78 156 aa16.06■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 TAS2R30P59541 319 aa16.06■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 C1orf87Q8N0U7 546 aa16.06■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 EXTL1Q92935 676 aa16.06■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 PRO3102Q9H379 93 aa16.06■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 HSPB6O14558 160 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 ZIC3O60481 467 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 MDKP21741 143 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 VDAC1P21796 283 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 HERPUD1Q15011 391 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 SSX3Q99909 188 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 DKKL1Q9UK85 242 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 RNF115Q9Y4L5 304 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 SLC22A20A6NK97 555 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 HLA-HP01893 362 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 TK1P04183 234 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 PSG4Q00888 419 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 FGFBP3Q8TAT2 258 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 ABHD14BQ96IU4 210 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 SNX22Q96L94 193 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF665Q9H7R5 613 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 CCL28Q9NRJ3 127 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa16.05■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 OR6C6A6NF89 314 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 RSG1Q9BU20 258 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 UFSP2Q9NUQ7 469 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM38BQ9NVV0 291 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 A0A087WZY1 265 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 A0A0G2JRQ6 117 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 PGA5P0DJD9 388 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 UCP1P25874 307 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 SLC25A24Q6NUK1 477 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 SSX9Q7RTT3 188 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 VSIRQ9H7M9 311 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 FAM86C1Q9NVL1 165 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 RARRES3Q9UL19 164 aa16.04■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 A0A1B0GU03 582 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 B4DEV8 164 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 CST2P09228 141 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 LIFP15018 202 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 DDTP30046 118 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 PROK2Q9HC23 129 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 IL24Q13007 206 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 LCN15Q6UWW0 184 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 M1APQ8TC57 530 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 HIST1H2BLQ99880 126 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 HIPK2Q9H2X6 1198 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 SMOC1Q9H4F8 434 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 Q9N2K0 584 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 RPRMQ9NS64 109 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF407Q9C0G0 2248 aa16.03■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 CLDN34H7C241 214 aa16.02■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 PHOX2AO14813 284 aa16.02■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 RND2P52198 227 aa16.02■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.02■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF880Q6PDB4 577 aa16.02■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 DPPA3Q6W0C5 159 aa16.02■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 STX12Q86Y82 276 aa16.02■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 OR10G4Q8NGN3 311 aa16.02■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 IL36RNQ9UBH0 155 aa16.02■□□□□ 0.16
CNIH3-201ENST00000272133 ZNHIT1O43257 154 aa16.02■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 BCL2P10415 239 aa16.02■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 BCL3P20749 454 aa16.02■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 PKIAP61925 76 aa16.02■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 SSX7Q7RTT5 188 aa16.02■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 WNT5BQ9H1J7 359 aa16.02■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 GDF9O60383 454 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 EDN3P14138 238 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 MMP9P14780 707 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 SSTP61278 116 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF787Q6DD87 383 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 A0A087X0M5 115 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 A0A1B0GX30 115 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 PCOLCEQ15113 449 aa16.01■□□□□ 0.15
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF726P1Q15940 193 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms