RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 TUBG1P23258 451 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 COL8A2P25067 703 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SLAMF9Q96A28 289 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 PKIBQ9C010 78 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM172BPA6NC97 362 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 G3V3Q6 166 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 RGS13O14921 159 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF250P15622 560 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 SELEP16581 610 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 FUT3P21217 361 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 CA6P23280 308 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 OR51I2Q9H344 312 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 SYNGR1O43759 233 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 OR3A3P47888 321 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 IL24Q13007 206 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 DHRS2Q13268 280 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM17Q86X19 198 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 F8VVB4 439 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 F8VWA3 439 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 FCGR3AP08637 254 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB25P24278 435 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 RAP2BP61225 183 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 PSG7Q13046 419 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MPPED2Q15777 294 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MPV17LQ2QL34 196 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 Q5BKY6 102 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 PPA2Q9H2U2 334 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM160Q9NX00 188 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 EHFQ9NZC4 300 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 J3QT63 122 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 GRK1Q15835 563 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 LYG2Q86SG7 212 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MICU1Q9BPX6 476 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 RHOFQ9HBH0 211 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 GPR132Q9UNW8 380 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 WNT9BO14905 357 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 FPR2P25090 351 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TAS2R31P59538 309 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TSPAN5P62079 268 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 LINC00596Q86U02 117 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ASB13Q8WXK3 278 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 CHODLQ9H9P2 273 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MPV17P39210 176 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 H2BFSP57053 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1R1AQ13522 171 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms