RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 C10orf35Q96D05 121 aa6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 KCTD7Q96MP8 289 aa6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OR4C12Q96R67 309 aa6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MNTQ99583 582 aa6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 RHOFQ9HBH0 211 aa6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 HMG20AQ9NP66 347 aa6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CALYQ9NYX4 217 aa6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.7□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1B0GTI1 187 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 LINC01548A6NM66 108 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 LINC01619G3V211 115 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 H3BSH0 61 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MOSP00540 346 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OCM2P0CE71 109 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 IL3RAP26951 378 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 NPBWR2P48146 333 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MTNR1BP49286 362 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 GNB1P62873 340 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 UBE2V2Q15819 145 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CGB2Q6NT52 195 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 HDXQ7Z353 690 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 Q8N6K4 173 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OR2T29Q8NH02 315 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ARPC1AQ92747 370 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 COQ2Q96H96 371 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 S1PR3Q99500 378 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ADI1Q9BV57 179 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 GNB4Q9HAV0 340 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ING3Q9NXR8 418 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 STUB1Q9UNE7 303 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PSG11Q9UQ72 335 aa6.69□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PRR32B1ATL7 298 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV3-7P01780 117 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ARSBP15848 533 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PRKACBP22694 351 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CD1BP29016 333 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 HCCSP53701 268 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CXCR4P61073 352 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 GINS1Q14691 196 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 LEAP2Q969E1 77 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SPSB1Q96BD6 273 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OR5B12Q96R08 314 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 NEK6Q9HC98 313 aa6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 KDM4BO94953 1096 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 APOL3O95236 402 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 KRT8P05787 483 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CALCBP10092 127 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PRDX6P30041 224 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 REG1BP48304 166 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SLURP1P55000 103 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MTCP1P56278 107 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SCN1BQ07699 218 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 HAGHQ16775 308 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 LTC4SQ16873 150 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ODF4Q2M2E3 257 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SPATS1Q496A3 300 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 UTF1Q5T230 341 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms