RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MED29Q9NX70 200 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC39A1Q9NY26 324 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 STMN3Q9NZ72 180 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 EMC3Q9P0I2 261 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GNG12Q9UBI6 72 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 DKKL1Q9UK85 242 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 HHLA2Q9UM44 414 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 R4GMQ9 66 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 USP24Q9UPU5 2620 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SPTBN2O15020 2390 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GTH9 108 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQ72 361 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf66A4D0T2 115 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM172BPA6NC97 362 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 A6NIN4 97 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GJE1A6NN92 205 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF726A6NNF4 738 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF878C9JN71 531 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SULT2B1O00204 365 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC17A2O00624 439 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TCRBP04435 133 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ISG15P05161 165 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PGA4P0DJD7 388 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PGA3P0DJD8 388 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ANXA3P12429 323 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL4P13236 92 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ICAM2P13598 275 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF17P17021 662 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF43P17038 809 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK2P24941 298 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 STOMP27105 288 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 HSD11B1P28845 292 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 BTCP35070 178 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEA5P43359 124 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 DNASE1L1P49184 302 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 POU3F4P49335 361 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN12P56749 244 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00205P59089 165 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R20P59543 309 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35A1P78382 337 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC36A2Q495M3 483 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL2L15Q5TBC7 163 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM244Q5VVB8 128 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RAET1LQ5VY80 246 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 LUZP2Q86TE4 346 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM156Q8N614 296 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR56B4Q8NH76 319 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6X1Q8NH79 312 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 LHX4Q969G2 390 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OXGR1Q96P68 337 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2M2Q96R28 347 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 EMC6Q9BV81 110 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 STRADBQ9C0K7 418 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTR6Q9GZN1 396 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.46□□□□□ -1.86
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