RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 OLFM3Q96PB7 478 aa3.35□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 DERL3Q96Q80 235 aa3.35□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.35□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 CHST5Q9GZS9 411 aa3.35□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM206AQ9NX38 181 aa3.35□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 SNX10Q9Y5X0 201 aa3.35□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 NOS1P29475 1434 aa3.35□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 H0Y980 276 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM250H0YL14 139 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 M0QZ92 97 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 AZIN1O14977 448 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 PFDN6O15212 129 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 SEC11BP0C7V7 166 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP10-12P60413 245 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 C4orf26Q17RF5 130 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 CPNE9Q8IYJ1 553 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 Q8N7P7 452 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 PIGXQ8TBF5 258 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 MS4A8Q9BY19 250 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 POMPQ9Y244 141 aa3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PIK3C3-211ENST00000589550 PLB1Q6P1J6 1458 aa3.34□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 K7EPK0 472 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CXorf1O96002 111 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 SERPINA6P08185 405 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 AGTR1P30556 359 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 IFNGR2P38484 337 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 HSPA13P48723 471 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 NOVP48745 357 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 KLHL12Q53G59 568 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF678Q5SXM1 525 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC35G3Q8N808 338 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 FRZBQ92765 325 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 FXYD5Q96DB9 178 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CYYR1Q96J86 154 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 HMGXB4Q9UGU5 601 aa3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 LRP4O75096 1905 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 METTL15A6NJ78 407 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ASS1P00966 412 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF83P51522 516 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 IMPG1Q17R60 797 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 LPCAT4Q643R3 524 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 Q6P435 159 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 XKRXQ6PP77 449 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 OR2M3Q8NG83 312 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ITFG2Q969R8 447 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PPCDCQ96CD2 204 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ULBP1Q9BZM6 244 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 LRRC19Q9H756 370 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 RWDD2AQ9UIY3 292 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ABCC11Q96J66 1382 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 RIMS2Q9UQ26 1411 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM131Q92545 1883 aa3.32□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CD28P10747 220 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 NTF3P20783 257 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CEBPGP53567 150 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MP68P56378 58 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 FADDQ13158 208 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 SKP2Q13309 424 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 SP6Q3SY56 376 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CYGBQ8WWM9 190 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TAMM41Q96BW9 452 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 IL37Q9NZH6 218 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.31□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 BTNL10A8MVZ5 291 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 M0R036 132 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CXCR6O00574 342 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 LHBP01229 141 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms