RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 ARL9Q6T311 187 aa6.27□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 GID4Q8IVV7 300 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 C3orf56Q8N813 242 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.27□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 MED30Q96HR3 178 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.26□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.26□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 CLIC3O95833 236 aa6.26□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.26□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 SPRNQ5BIV9 151 aa6.26□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.26□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 S1PR3Q99500 378 aa6.26□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 ACKR3P25106 362 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 HTR1FP30939 366 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 IL2RGP31785 369 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 CXCR4P61073 352 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 ZNF92Q03936 586 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4D-210ENST00000588972 YIPF5Q969M3 257 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 HAVCR1Q96D42 359 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 CXorf58Q96LI9 332 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 APOL4Q9BPW4 351 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 Q9H521 79 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 TREM2Q9NZC2 230 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 CACNG2Q9Y698 323 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GWJ7 208 aa6.24□□□□□ -1.41
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