RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 VAX1Q5SQQ9 334 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PLET1Q6UQ28 207 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF497Q6ZNH5 498 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 MOB1BQ7L9L4 216 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5AP2Q8NGF4 316 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 OCEL1Q9H607 264 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ANXA10Q9UJ72 324 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 DISC1C4P0D8 188 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF737O75373 536 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRA2P47869 451 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM201AQ5SY85 155 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35E4Q6ICL7 350 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf107Q6ZR85 190 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5H2Q8NGV7 314 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF665Q9H7R5 613 aa25.97■■□□□ 1.75
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CAPNS1-206ENST00000588815 SSX4O60224 188 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 FCER2P06734 321 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HRH1P35367 487 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRFAM7AQ494W8 412 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF880Q6PDB4 577 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ARRDC1Q8N5I2 433 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5D13Q8NGL4 314 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM234AQ9H0X4 552 aa25.96■■□□□ 1.75
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A8Q9NY64 477 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRK2Q5S007 2527 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM82A0PJX8 343 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA2O43678 99 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 GIFP27352 417 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DS4P43632 304 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 OR3A1P47881 315 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 OR3A3P47888 321 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DS1Q14954 304 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF788Q6ZQV5 615 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRT1Q99946 306 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 K7N7A8 449 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 AMY2AP04746 511 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA6P05013 189 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4D10Q8NGI6 311 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SHARPINQ9H0F6 387 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX6-3A6NJ46 265 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 M0QYG6 137 aa25.93■■□□□ 1.74
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CAPNS1-206ENST00000588815 ARPC4P59998 168 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 GRK1Q15835 563 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MED30Q96HR3 178 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 METRNQ9UJH8 293 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 A1L4Q6 167 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 RP2O75695 350 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TCRBP04435 133 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF735P0CB33 412 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK10Q15131 360 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 FAAP20Q6NZ36 180 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM17Q86X19 198 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 OR56B4Q8NH76 319 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MAFIPQ8WZ33 124 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CREB3L1Q96BA8 519 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MAB21L2Q9Y586 359 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 OVOL3O00110 214 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SIGLEC5O15389 551 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 PMP2P02689 132 aa25.91■■□□□ 1.74
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CAPNS1-206ENST00000588815 OVCH2Q7RTZ1 564 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB108BQ8NET1 73 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51S1Q8NGJ8 323 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFBPL1Q8WX77 278 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MARVELD1Q9BSK0 173 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NECAP2Q9NVZ3 263 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK11Q5JSL3 2073 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 FUOMA2VDF0 154 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 GYPAP02724 150 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TK1P04183 234 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CCR6P51684 374 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 BTG1P62324 171 aa25.91■■□□□ 1.74
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