RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 CRIM1Q9NZV1 1036 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 JKAMPQ9P055 326 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 PFDN2Q9UHV9 154 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 GLAP06280 429 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 SFTPBP07988 381 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMXP38159 391 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 NAAAQ02083 359 aa21.7■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 NRGNQ92686 78 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 BOD1Q96IK1 185 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 DNTTIP1Q9H147 329 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 SESN1Q9Y6P5 492 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 IL18BPO95998 194 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 GLRA1P23415 457 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 IL15RAQ13261 267 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 STOML3Q8TAV4 291 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC20Q8TCA0 184 aa21.7■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD55Q3KP44 614 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A26Q70HW3 274 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 SPACA1Q9HBV2 294 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 RASL12Q9NYN1 266 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 RDH8Q9NYR8 311 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR160Q9UJ42 338 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 CD300LBA8K4G0 201 aa21.68■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 OPRM1P35372 400 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 TGFBR3Q03167 851 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9A3R2Q15599 337 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGYQ3MUY2 71 aa21.68■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa21.67■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM222BQ8WU58 562 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 HPSE2Q8WWQ2 592 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC46Q96FV0 321 aa21.67■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLCF1Q9UBD9 225 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS50Q9UI38 385 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 I3L521 148 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF728P0DKX0 622 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 IL13RA2Q14627 380 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 C9orf135Q5VTT2 229 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF573Q86YE8 665 aa21.66■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 SYT3Q9BQG1 590 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF126Q9BV68 326 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC38A6Q8IZM9 456 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM185AQ8N0U4 392 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5P3Q8WZ94 311 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 WNT2BQ93097 391 aa21.65■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 SDHAF2Q9NX18 166 aa21.65■■□□□ 1.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 IFNA21P01568 189 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNOP22674 350 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 TFAP2EQ6VUC0 442 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 P4HA3Q7Z4N8 544 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 LIME1Q9H400 295 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP57Q9NU63 452 aa21.65■■□□□ 1.06
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