RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	GYPB	P06028	91 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PATE4	P0C8F1	98 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	UBL4A	P11441	157 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CTRB1	P17538	263 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ELK1	P19419	428 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MYL9	P24844	172 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	APLNR	P35414	380 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	DDOST	P39656	456 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MAP2K3	P46734	347 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR10A3	P58181	314 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR12D2	P58182	307 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	COPZ1	P61923	177 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	BDH1	Q02338	343 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SCN1B	Q07699	218 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CRMP1	Q14194	572 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GALE	Q14376	348 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SSX2	Q16385	188 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL12	Q53G59	568 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	DDI2	Q5TDH0	399 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF626	Q68DY1	528 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LCN12	Q6JVE5	192 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF613	Q6PF04	617 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RRM2B	Q7LG56	351 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GID4	Q8IVV7	300 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	COX18	Q8N8Q8	333 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR5J2	Q8NH18	312 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR51A7	Q8NH64	312 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RFK	Q969G6	155 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OTULIN	Q96BN8	352 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SEH1L	Q96EE3	360 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TEAD3	Q99594	435 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ALG8	Q9BVK2	526 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IFT27	Q9BW83	186 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GON7	Q9BXV9	100 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC22A4	Q9H015	551 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	POLE3	Q9NRF9	147 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CMC2	Q9NRP2	79 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	DAPL1	A0PJW8	107 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SNTN	A6NMZ2	147 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SERPINE3	A8MV23	424 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PANO1	I0J062	215 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772		J3QLW9	94 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OGG1	O15527	345 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CHP2	O43745	196 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IDH3B	O43837	385 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SC5D	O75845	299 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	AK1	P00568	194 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IGHG2	P01859	326 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IGHG4	P01861	327 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	HLA-DPB1	P04440	258 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GUSB	P08236	651 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF19	P17023	458 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GAL	P22466	123 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	3.62	□□□□□ -1.83	3e-15	■■■■■ 37.3
MSI2-216	ENST00000582772	PSMB8	P28062	276 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	HLA-DMA	P28067	261 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IFNA8	P32881	189 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	BTC	P35070	178 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CLDN17	P56750	224 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CD81	P60033	236 aa		3.62	□□□□□ -1.83

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