RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 COX7A1P24310 79 aa18.8■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 FOXC1Q12948 553 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 R3HDM4Q96D70 268 aa18.79■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 WNT16Q9UBV4 365 aa18.79■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.79■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM65Q6PI78 240 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRM-211ENST00000580170 RASL10BQ96S79 203 aa18.78■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 TUSC1Q2TAM9 212 aa18.78■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 OR4S2Q8NH73 311 aa18.78■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 OR10G8Q8NGN5 311 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf35Q96D05 121 aa18.78■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 CT55Q8WUE5 264 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRM-211ENST00000580170 ABCA3Q99758 1704 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRM-211ENST00000580170 SIAH2O43255 324 aa18.77■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF880Q6PDB4 577 aa18.77■□□□□ 0.59
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF205O95201 554 aa18.76■□□□□ 0.59
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PTPRM-211ENST00000580170 LHX9Q9NQ69 397 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 STRCQ7RTU9 1775 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 FAM90A27PA6NNH2 459 aa18.76■□□□□ 0.59
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PTPRM-211ENST00000580170 MPV17LQ2QL34 196 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM167BQ9NRX6 74 aa18.76■□□□□ 0.59
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