RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 TNFRSF11BO00300 401 aa8□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SH2D1BO14796 132 aa8□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF254O75437 659 aa8□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 COX4I1P13073 169 aa8□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 FSTP19883 344 aa8□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 REG1BP48304 166 aa8□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 RAB9AP51151 201 aa8□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM104Q8NE00 496 aa8□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TTTY10Q9BZA0 68 aa8□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.99□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.99□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 CCNB2O95067 398 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 BRI3O95415 125 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 LTC4SQ16873 150 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 CPOQ8IVL8 374 aa7.99□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 BORCS8Q96FH0 119 aa7.99□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.99□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.99□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.98□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 E2F6O75461 281 aa7.98□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.98□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 APOL4Q9BPW4 351 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.98□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 CALYQ9NYX4 217 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 STUB1Q9UNE7 303 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 R4GMQ9 66 aa7.98□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF44P15621 663 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 CD1BP29016 333 aa7.97□□□□□ -1.13
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CTDNEP1-202ENST00000570380 GLP1RP43220 463 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBP2P50120 134 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 GALEQ14376 348 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 CGB2Q6NT52 195 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF565Q8N9K5 539 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDNEP1-202ENST00000570380 RFESDQ8TAC1 157 aa7.97□□□□□ -1.13
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