RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563473.1

RPL4-204, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 3

Gene RPL4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-204	ENST00000563473	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473		Q8N402	240 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473		A0A1W2PP11	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473		A0A1W2PRF3	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473		A0A1W2PRG6	482 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473		A0A1W2PRM7	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473		M0R036	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	BIRC5	O15392	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	SGCE	O43556	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	SERPINB7	O75635	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	DIRAS1	O95057	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	IGHV2-5	P01817	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	IGHG1	P01857	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	NPS	P0C0P6	89 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	MAK	P20794	623 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	GLRA1	P23415	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	PRTN3	P24158	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	AQP1	P29972	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	CD81	P60033	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	CD47	Q08722	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	OR1Q1	Q15612	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ARL9	Q6T311	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	RORB	Q92753	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	MAL2	Q969L2	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	RPE	Q96AT9	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	MMP28	Q9H239	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	GLTP	Q9NZD2	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473		V9GYY9	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL4-204	ENST00000563473		A0A0G2JK05	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	CCL24	O00175	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	PLPP3	O14495	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	HSPB6	O14558	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	IMPA2	O14732	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	ARPC2	O15144	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	TM9SF1	O15321	606 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	FZD7	O75084	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	NPIPB7	O75200	414 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	RP2	O75695	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	IL12A	P29459	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	CX3CR1	P49238	355 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	ZP1	P60852	638 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	GNB2	P62879	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	CDK6	Q00534	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL4-204	ENST00000563473	RGN	Q15493	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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