RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM59Q9BXS4 323 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ATRQ13535 2644 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0A6YYJ9 748 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ODAMA1E959 279 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM64CA6NLI5 447 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 C17orf98A8MV24 154 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 H3BUI4 141 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 MPIG6BO95866 241 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 VSIG8P0DPA2 414 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 GLIPR1P48060 266 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 DLX6P56179 175 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ERVFRD-1P60508 538 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 USP43Q70EL4 1123 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 NEK7Q8TDX7 302 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 BARHL1Q9BZE3 327 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ING3Q9NXR8 418 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF581Q9P0T4 197 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 SHISA3A0PJX4 238 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 CLPXO76031 633 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ARSBP15848 533 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB3BP20337 219 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 GADD45AP24522 165 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 KLRD1Q13241 179 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 P2RY14Q15391 338 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 OR2W3Q7Z3T1 314 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 PDZD9Q8IXQ8 264 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFRSF14Q92956 283 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 JMJD8Q96S16 334 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 OR51E2Q9H255 320 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 OR6C3Q9NZP0 311 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 CUBNO60494 3623 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 CFPP27918 469 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2E1P51965 193 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 DLX1P56177 255 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 OR10A3P58181 314 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 HILS1P60008 231 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 TUSC1Q2TAM9 212 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB12Q6IQ22 244 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC25A28Q96A46 364 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 KCTD7Q96MP8 289 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNK15Q9H427 330 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 STEAP1Q9UHE8 339 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF25Q9UIL4 384 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 MEIKINA0A087WXM9 373 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 IFITM5A6NNB3 132 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM14DPA8MWL7 114 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 GLP1RP43220 463 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 QRFPP83859 136 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 UNC119Q13432 240 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 OR10K2Q6IF99 312 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 TPRA1Q86W33 373 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 CORO2AQ92828 525 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 AIPO00170 330 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 NPFFO15130 113 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 PDCD6O75340 191 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 IGHV1-8P0DP01 117 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 FUT3P21217 361 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 CLDN12P56749 244 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 HES5Q5TA89 166 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC35E4Q6ICL7 350 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 OR51D1Q8NGF3 324 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 FBLN5Q9UBX5 448 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 GLAP06280 429 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SMIM18P0DKX4 95 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 COX7A1P24310 79 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SAA4P35542 130 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SIGIRRQ6IA17 410 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 HCP5Q6MZN7 132 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms